트랜스모퍼 사건 발생 20년 후, 더 진화되고 새로워진 외계 로봇 종족이 재건된 지구에 내려와 다시 한 번 행성을 파괴할 위협을 가하고 인류는 그들과 싸우기 위해 고군분투 한다.