대서양 바다 속에서 해저탐사 중이던 오션 랩 호가 해저지진으로 파괴되고 그 안의 승무원들은 실종된다. 정부의 잠수함이 동원되고 해저를 뒤지지만 오션 랩호의 승무원을 역시 찾지 못한다. 트라이튼 호는 넵튠이라는 해저 탐사선을 통해 오션 랩을 찾는데 의견을 모으고 해저 탐서선 넵튠은 마침내 오션 랩호를 찾아 나선다. 최초의 조사결과 오션 랩호의 부서진 잔재만을 가지고 온 넵튠은 더 깊은 곳에서 재시도를 하게 된다. 그러나 바다 위의 모선과 연결된 보조선이하로 더 내려가기를 망설이는 넵튠 호 선장과 여승무원이 갈등을 일으키고 여승무원의 순간적인 행동으로 모선과의 연결선이 끊어져 넵튠 호는 더 깊은 심해 속으로 빠져들어가는데....