마피아의 불법 해상 카지노 털이를 통해 미국 근현대사의 비밀을 알고 싶었던 루팡, 하지만 시크릿 7이란 미지의 조직이 그를 추격해 암살하고자 한다. 한편 그 과정에서 루팡을 잡아 체포한 제니가타지만 무언가 묘한 일이 뒤에서 벌어진다는 사실에 루팡과 협력하게 된다. 반면 시크릿 7은 알카트라즈 부흥을 위해 남은 인원을 동원해 최후의 작전에 돌입하게 되는데...